我國藥典記載馬蘭頭跟是無毒的，但是從一些醫學臨床和生活食用案例看，馬蘭頭根還是有一定副作用的。

有關馬蘭頭根的臨床應用報告指出，馬蘭的鎮咳作用較好，對祛痰、平喘、消炎也有一定效果。服藥后僅極少數在1～2天內出現上腹不適、胸悶、嘔吐等副作用。  

在網上也常看到，一些網友用馬蘭頭根燉湯或水煎喝，出現舌頭發麻或皮膚過敏等情況。雖然不能直接說明馬蘭頭的有毒，但是副作用還是有的，癥狀也是因人而異。

馬蘭頭跟雖然含有豐富的維生素和無機鹽，有“天然抗生素”的美稱，但是俗話說“是藥三分毒”，藥總是會有副作用的，為了我們的健康，我們還是不能忽視馬蘭頭副作用的存在。

如果您食用馬蘭頭根發生了副作用，例如口干、便秘、乏力等，如果沒有嚴重影響日常生活，可以不必特殊處理。如果出現不明原因的皮疹、呼吸困難、吞咽困難等，建議到醫院就醫。