關于馬蘭頭根的功效，我國各種藥典均有詳實的記載。現代醫學研究也表明，馬蘭頭對大腸桿菌、痢疾桿菌和傷寒桿菌均有明顯的抗菌作用；對金黃色葡萄球菌有強力抑制作用，因而有“天然抗生素”的美稱。馬蘭頭跟還具有降血壓、抗癌、散血、消腫，利筋、解毒、通麻等的作用。關于馬蘭頭根的功效及藥用做法，我國各藥店大致記載如下：

《云南中草藥》："根：祛風散寒，止咳平喘。治支氣管炎，支氣管哮喘，風濕痹痛，小兒疝氣。"

《日華子本草》："根、葉，破宿血，養新血，止鼻衄，吐血，合金瘡，斷血痢，解酒疸及諸菌毒；生搗敷蛇咬。"

《綱目》："根、葉，主諸瘧及腹中急痛，痔瘡。"

《集成良方三百種》馬蘭頭根治吐血：鮮白茅根四兩(白嫩去心)，馬蘭頭四兩(連根)，湘蓮子四兩，紅棗四兩。先將茅根、馬蘭頭洗凈，同入鍋內濃煎二、三次濾去渣，再加入湘蓮、紅棗入罐內，用文火燉之。晚間臨睡時取食一兩。

《壽域神方》馬蘭頭根治絞腸痧痛：馬蘭根葉細嚼，咽汁。

《浙江民間常用草藥》馬蘭頭根治胃潰瘍、結膜炎：馬蘭鮮根二兩。水煎服。

《孫一松試效方》馬蘭頭根治喉痹口緊：馬蘭根或葉搗汁，入米醋少許，滴鼻孔中，或灌喉中，取痰自開。

《江西民間草藥》馬蘭頭根治咽喉腫痛：馬蘭全草一、二兩。水煎頻服。

《福建中草藥》馬蘭頭根治急性睪丸炎：馬蘭鮮根二至三兩，荔枝核十枚。水煎服。

《中草藥治腫瘤資料選編》治腮腺癌：馬蘭頭根(白)，野胡蔥頭各適量搗爛外敷。