新生兒腦積水會導致頭圍增大。嬰兒出生后數周或數月內頭顱不斷增大，前囟也隨之擴大和膨隆。頭顱與軀干的生長比例失調，如頭顱過大過重而垂落在胸前，頭顱和臉面不相稱，頭大臉小，而且寶寶的頭皮有光澤。

還有前囟擴大、張力增高的癥狀。豎著抱小寶寶時，囟門仍呈膨隆狀而不凹陷，也看不到正常搏動時則表示顱內壓增高。嬰兒期顱內壓力增高的主要表現是嘔吐，由于嬰兒尚不會說話，所以他們疼痛和不舒服的時候常常抓頭、搖頭、哭叫，病情加重時愛打瞌睡或昏睡。

還會產生“落日目”現象。腦積水的進一步發展，會產生類似帕里諾眼肌麻痹綜合征，即上凝視麻痹，使嬰兒的眼球只能注視前方和往下看，眼球無法往上看，這就是所謂的“落日目”。