干擾素雖然對乙肝病毒有效，但也是有適應癥的，并非對什么樣的乙肝都能“干擾”，如用藥不當，還會加重病情，適得其反。

1.慢性遷延性肝炎或慢性活動性肝炎，轉氨酶在150-200單位，應用干擾素可產生更多的抗病毒蛋白及多種免疫調節因子，能更好地發生應答反應，以清除乙肝病毒。

2.所染乙肝病毒為野生株，未發生變異。

3.血清游離鐵處于低水平，因為血清中的游離鐵可拮抗干擾素。

4.肝活檢有活動性炎癥病變，如碎屑樣壞死。

5.無重疊感染丙肝、丁肝。

6.病程較短。

下列情況應用干擾素效果差、無效或有害：

1.乙肝病毒攜帶者，干擾素無法發揮作用。

2.乙肝病毒已發生變異，干擾素很難奏效。

3.乙肝來自于垂直感染，如母嬰感染或父嬰感染。這類乙肝病毒多具免疫耐受、基因整合和基因變異的特點，干擾素對這類情況常常無可奈何。歐美的乙肝垂直感染只占6%，他們使用干擾素治乙肝效果明顯，而我國的乙肝80%為垂直感染而來，所以用進口的干擾素治療國人的乙肝往往療效平平，表現出明顯的“水土不服”。

4.重型肝炎。因為重型肝炎，尤其是失代償性肝炎后肝硬化，應用干擾素后，有加重肝損害、導致病情惡化甚至使病人死亡的可能性。