免疫接種的目的是刺激機體產生針對某些特異性抗原的免疫反應。副反應即不良反應，是由疫苗引起的一種邊際效應，與疫苗產生免疫的初衷無關。疫苗副反應包括發生在免疫接種后的任何不利反應。不利反應有可能是疫苗引起的，也可能是巧合事件。流腦疫苗不是對每個孩子都有副反應，如果有，一般都是低燒，極少數為高燒。

腦膜炎疫苗接種后的反應：接種流腦多糖疫苗后反應都比較輕微。局部可有些紅暈和壓痛，一般24小時內消退，少數人在注射局部還會出現小的硬塊。大多數人沒有全身反應的癥狀，偶爾有人出現短暫的低熱。

一般打針后48小時發熱到達高峰，以后逐步恢復正常，如體溫居高不降，速去醫院請醫生診治。一般患有發燒的兒童是不能注射這種疫苗的。一般接種流腦疫苗后的反應應該比較輕微，偶爾有人出現短暫低熱，有些大孩子偶爾出現過敏反應，即在接種后的十幾個小時皮膚出現皰疹等，此時應請醫生診治。注射局部可能出現紅暈和壓痛，一般在24小時內消退，不用特殊處理。發燒時不能用退燒藥，只能用物理降溫的辦法（即用冰袋、涼毛巾降溫）。