瓠瓜除了能盛藥，本身也可為藥。瓠瓜味甘，性平滑無毒，其蔓、須、葉、花、子、殼均可入藥，醫治多種疾病。據古代醫書記載，瓠瓜花味甘，性平，無毒，可做解毒之藥，對各種瘺瘡尤為有效。蔓、須藥性與花相同，可治麻瘡。瓠瓜瓤及子，味苦，性寒，有毒，可治牙病，牙齦或腫或露，牙齒松動。又可治面目、四肢腫，小便不通，鼻塞，及一切癰疽惡瘡。尤以瓠瓜殼的藥用價值最高，其味甘，性平，無毒，用于消熱解毒，潤肺利便。愈是陳年的瓠瓜殼，療效愈高。